是的，根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》第三十四條規(guī)定，企業(yè)在計算土地增值稅時，可以作為扣除基數(shù)，加計扣除間接費用。具體來說，除了直接費用，企業(yè)還可以從投資收益、經(jīng)營收入和貨物銷售收入中扣除間接費用，以減少計算所得稅的金額。間接費用包括但不限于：研究開發(fā)費用、咨詢費用、營銷費用、管理費用、行政費用、保險費用、公關費用、差旅費用、運輸費用等等。此外，企業(yè)還可以根據(jù)企業(yè)實際情況，根據(jù)有關規(guī)定，經(jīng)當?shù)囟悇諜C關批準，將其他合理的間接費用作為扣除基數(shù)，加計扣除。