1、審理機(jī)關(guān)不同。行政復(fù)議是由作出具體行政行為的行政機(jī)關(guān)的上級(jí)行政機(jī)關(guān)審理，而行政訴訟則是由作出具體行政行為的行政機(jī)關(guān)所在地的人民法院審理。 
2、法律依據(jù)不同。行政復(fù)議依據(jù)的是《行政復(fù)議法》及《行政復(fù)議法實(shí)施條例》，而行政訴訟則是依據(jù)《行政訴訟法》。 
3、程序不同。行政復(fù)議只有一級(jí)，即行政復(fù)議決定作出后行政復(fù)議程序即終止，對(duì)行政復(fù)議決定不服只能依法向人民法院提起行政訴訟。而行政訴訟則對(duì)一審法院作出判決不服還可向上級(jí)法院提起上訴。在審理過(guò)程中，行政復(fù)議一般是書(shū)面審，只有在必要時(shí)，才可舉行聽(tīng)證或當(dāng)面聽(tīng)取有關(guān)人員意見(jiàn)。而行政訴訟除特殊案件外，一般均可公開(kāi)審理，且具有交換證據(jù)、法庭調(diào)查、質(zhì)證、辯論等程序。 
行政復(fù)議實(shí)行行政首長(zhǎng)負(fù)責(zé)制，即行政復(fù)議結(jié)論的決定權(quán)由行政機(jī)關(guān)層級(jí)審批，行政首長(zhǎng)最終決定。而行政訴訟實(shí)行合議制。 
4、結(jié)案方式不同。行政復(fù)議可以由行政機(jī)關(guān)為申請(qǐng)人和被申請(qǐng)人調(diào)解，申請(qǐng)人與本申請(qǐng)人也可自愿達(dá)成和解，而行政訴訟不適用調(diào)解。 
5、審理的內(nèi)容不同。行政復(fù)議既要審查具體行政行為的合法性，也要審查其適當(dāng)性，并可依法作出復(fù)議決定。而行政訴訟原則上只審查具體行政行為的合法性，雖也對(duì)適當(dāng)性進(jìn)行審查，但一般不就行政機(jī)關(guān)的具體行政行為的適當(dāng)性作出裁決。 
6、行政復(fù)議不收費(fèi)，行政訴訟收費(fèi)。