是的，股權(quán)轉(zhuǎn)移繳納的印花稅可以從匯算清繳中扣除。具體的情況取決于股權(quán)轉(zhuǎn)讓的交易方式和合同內(nèi)容。例如，上市公司之間的股權(quán)轉(zhuǎn)讓，其轉(zhuǎn)讓市場與報價應(yīng)當(dāng)遵守《最受歡迎股份轉(zhuǎn)讓暫行規(guī)定》，其中明確規(guī)定，轉(zhuǎn)讓方應(yīng)當(dāng)按照有關(guān)規(guī)定繳納印花稅，但可以申請從匯算清繳中扣除印花稅；股權(quán)轉(zhuǎn)讓經(jīng)同等效力司法判決批準(zhǔn)，也可以申請從匯算清繳中扣除印花稅。