2018年1月1日，收費公路通行費增值稅電子普通發(fā)票開始應(yīng)用了，由此帶來了通行費增值稅進項稅額抵扣的方式變化： 
 
  情形一：未辦理ETC卡或用戶卡的現(xiàn)金客戶，暫按原有方式交納通行費和索取票據(jù)。 
 
  這種方式的抵扣，沒有辦法，還是老辦法，即財稅【2016】86號文件： 
 
  一、增值稅一般納稅人支付的道路、橋、閘通行費，暫憑取得的通行費發(fā)票（不含財政票據(jù)，下同）上注明的收費金額按照下列公式計算可抵扣的進項稅額： 
 
  高速公路通行費可抵扣進項稅額=高速公路通行費發(fā)票上注明的金額÷（1+3%）×3% 
 
  一級公路、二級公路、橋、閘通行費可抵扣進項稅額=一級公路、二級公路、橋、閘通行費發(fā)票上注明的金額÷（1+5%）×5% 
 
  通行費，是指有關(guān)單位依法或者依規(guī)設(shè)立并收取的過路、過橋和過閘費用。 
 
  第三只眼：這種情形下，抵扣方式還是老的固定式的抵扣方式，且沒有時限要求。這種票據(jù)的抵扣填寫在“其他扣稅憑證”的“其他”項下。 
 
  情形二：ETC后付費客戶和用戶卡客戶 
 
  通過經(jīng)營性收費公路的部分，在發(fā)票服務(wù)平臺取得由收費公路經(jīng)營管理單位開具的征稅發(fā)票；通過政府還貸性收費公路的部分，在發(fā)票服務(wù)平臺取得暫由ETC客戶服務(wù)機構(gòu)開具的不征稅發(fā)票。 
 
  第三只眼：這種情形下，即為新的通行費電子普通發(fā)票，這類普通發(fā)票，在抵扣時就不執(zhí)行財稅【2016】86號文件了，而是根據(jù)開具的發(fā)票上的顯示的“適用稅率”或“征收率”計算出來的稅額進行抵扣。如何抵扣呢？ 
 
  增值稅一般納稅人取得符合規(guī)定的通行費電子發(fā)票后，應(yīng)當自開具之日起360日內(nèi)登錄本?。▍^(qū)、市）增值稅發(fā)票選擇確認平臺,查詢、選擇用于申報抵扣的通行費電子發(fā)票信息。 
 
  增值稅一般納稅人申報抵扣的通行費電子發(fā)票進項稅額，在納稅申報時應(yīng)當填寫在《增值稅納稅申報表附列資料（二）》（本期進項稅額明細）中“認證相符的增值稅專用發(fā)票”相關(guān)欄次中。 
 
  這是什么意思，普通發(fā)票當“專用發(fā)票”使用了，而且還有360天，其實這個事兒，我們也是要非常重視的，因為有時一旦填“錯行”，有可能被稅務(wù)部門得出不讓抵扣的結(jié)果。不過這個也算是“認證”程序了。 
 
  情形三：ETC預(yù)付費客戶 
 
  在充值后索取發(fā)票的，在發(fā)票服務(wù)平臺取得由ETC客戶服務(wù)機構(gòu)全額開具的不征稅發(fā)票，實際發(fā)生通行費用后，ETC客戶服務(wù)機構(gòu)和收費公路經(jīng)營管理單位均不再向其開具發(fā)票。 
 
  客戶在充值后未索取不征稅發(fā)票，在實際發(fā)生通行費用后索取發(fā)票的，通過經(jīng)營性收費公路的部分，在發(fā)票服務(wù)平臺取得由收費公路經(jīng)營管理單位開具的征稅發(fā)票；通過政府還貸性收費公路的部分，在發(fā)票服務(wù)平臺取得暫由ETC客戶服務(wù)機構(gòu)開具的不征稅發(fā)票。 
 
  第三只眼：這兒預(yù)付費，如果當時就要發(fā)票，小編認為如果不涉及抵扣的可以要，但是如果涉及抵扣的，就不要，在實際發(fā)生通行費后再網(wǎng)上取得，其中經(jīng)營性的是可以抵扣的，這個有點兒“嚴格”，難道是怕納稅人報銷重復(fù)了嗎？或許有這方面的擔(dān)心的。 
 
  如果取得了征稅發(fā)票，則就可以進行抵扣操作，同時按照上面的抵扣方式進行操作。有的人可能提到，不征稅的難道不能選擇嗎？關(guān)鍵是不征稅的都分不清稅額如何選擇抵扣？ 
 
  情形四：通行費電子發(fā)票的稅率或征收率改變 
 
  財稅【2016】86號是按固定的征收率來操作的，如果是按稅率或征收率，則有可能是3%，也有可能是11%，對于簡易的，因為是涉及： 
 
  公路經(jīng)營企業(yè)中的一般納稅人收取試點前開工的高速公路的車輛通行費，可以選擇適用簡易計稅方法，減按3%的征收率計算應(yīng)納稅額。 
 
  試點前開工的高速公路，是指相關(guān)施工許可證明上注明的合同開工日期在2016年4月30日前的高速公路。 
 
  所以如果不滿足上面條件，且未選擇3%的，則就是按不動產(chǎn)經(jīng)營租賃計稅，稅率就是11%的，此時抵扣可能就是有利起來，但是這個由于剛營改增，估計仍是3%的多。 
 
  所以2018年以后，通行費真的復(fù)雜起來，對于一級公路，二級公路，橋、閘通行費，還是按5%，部分地區(qū)試點一級公路ETC收費，理解上也是按上面的分析進行涉稅處理的。